东南教育网您的位置:首页 >新闻 > 人物采访 >

加州大学圣克鲁斯基因组研究所与微软合作

加州大学圣克鲁兹基因组研究所(UC Santa Cruz Genomics Institute)与微软(Microsoft)建立了合作伙伴关系,将帮助研究人员利用该公司的云计算平台微软Azure加速分析基因组信息。这项合作为基因组研究所提供了新的计算、数据存储和分析能力,使研究人员能够更容易地合作和共享信息,并加快科学发现的速度。

“基因组学越来越依赖大规模计算,这种合作关系使我们能够为几个重大项目做大量基于云的计算,”加州大学圣克鲁兹分校(UC Santa Cruz)大数据转化基因组学中心(Center for Big Data in Translational Genomics)的助理主任、研究科学家Benedict Paten说。

Azure平台将用于各种基因组学项目,UCSC的研究人员将在这些项目中帮助生物医学社区在癌症和其他疾病的诊断和治疗中更有效地使用基因组信息。其中包括最近资助的加州儿童癌症比较,该项目将使用基因组分析来帮助医生识别对标准治疗无效的加州癌症儿童的有效治疗方法;基因组研究所参与国际癌症基因组联盟,该联盟正致力于生成50种不同肿瘤类型和亚型的基因组异常的综合目录;人类基因组变异图谱项目旨在开发出一套完整的人类遗传变异图谱。

“UCSC基因组研究所是一个专注于推动疾病靶向治疗的一流基因组实验室,”微软研究院(Microsoft Research)客户端和云应用主管道格·伯格(Doug Burger)说。“Azure提供规模和效率,帮助研究所的研究人员管理大量基因组数据集,同时满足严格的数据使用、安全和隐私要求。”

加州大学圣克鲁斯基因组研究所的科学主任David Haussler说,与微软的合作将加速该研究所在癌症基因组学和其他领域项目的进展。“微软的资源可以对基因组学产生重大影响,”Haussler说。“他们有云计算方面的专业知识,而我们有基因组学方面的专业知识,因此这种合作具有巨大的潜力。”

云计算为基因组学研究项目提供了许多优势,这些项目需要对大数据集进行密集的计算分析。Paten说,商业云服务的灵活性意味着研究人员可以在任何给定的时间访问他们需要的所有计算能力,因此他们可以更快地进行分析。

他说:“共享计算资源比拥有计算资源更有效。”“随着基因组数据的数量呈指数级增长,利用商业云的规模是有意义的。”

2015年3月,美国国家卫生研究院(National Institutes of Health, NIH)取消了此前对使用云系统存储和分析人类基因组数据的限制,为满足NIH数据使用和安全标准的云服务商业提供商与基因组研究社区合作扫清了道路。

郑重声明:本文版权归原作者所有,转载文章仅为传播更多信息之目的,如有侵权行为,请第一时间联系我们修改或删除,多谢。